ไหมเป็นเส้นใยโปรตีนที่เรียกว่าไหมไฟโบรอิน เป็นสารประกอบพอลิเมอร์ที่ประกอบด้วยไนโตรเจน เบสเดี่ยวของโมเลกุลขนาดใหญ่คือกรดอัลฟาอะมิโน สูตรโครงสร้างทั่วไปของกรดอะมิโน α คือ RCH (NH2) คสอ. เนื่องจากหมู่อะมิโนของมันตั้งอยู่บนอะตอม α คาร์บอน ถัดจากหมู่คาร์บอกซิลหรือกรดคาร์บอกซิลิก จึงเรียกว่ากรดอะมิโน α ตามสูตรโครงสร้างทั่วไปของโมเลกุลไหมไฟโบรอิน กลุ่มด้านข้างที่เชื่อมต่อกับกลุ่มเปปไทด์ที่แตกต่างกันในสายโซ่โมเลกุลขนาดใหญ่ทั้งหมดนั้นแตกต่างกัน ซึ่งเป็นคุณสมบัติที่สำคัญของเส้นใยโปรตีนธรรมชาติ
มีกรดอะมิโน 18 ชนิดที่ประกอบเป็นซิลค์ไฟโบรอิน เนื้อหาของไหมไฟโบรอินมีสัดส่วนประมาณ 70%-80% ของไหม ในหมู่พวกเขา glycine (gly), alanine (ala) และ serine (ser) คิดเป็นประมาณ 80% ขององค์ประกอบทั้งหมด
